More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2325 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  49.63 
 
 
284 aa  289  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  50 
 
 
281 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  46.91 
 
 
290 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  44.77 
 
 
286 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  44.53 
 
 
274 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  44 
 
 
291 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2051  MCP methyltransferase, CheR-type  42.86 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  hitchhiker  0.000266106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  37.68 
 
 
283 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  36.73 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  36 
 
 
291 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  37.68 
 
 
292 aa  198  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
297 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.38 
 
 
289 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.14 
 
 
291 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  36.69 
 
 
280 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  35.61 
 
 
327 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 
288 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  35.61 
 
 
291 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  37.41 
 
 
553 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 
288 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  34.78 
 
 
292 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  34.78 
 
 
275 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  35.51 
 
 
275 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  36.76 
 
 
305 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  36.36 
 
 
305 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.1 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1796  protein-glutamate O-methyltransferase  37.74 
 
 
294 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  35.14 
 
 
269 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 
271 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
272 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  35.19 
 
 
283 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  34.66 
 
 
277 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  35.04 
 
 
298 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
290 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  32.73 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  33.82 
 
 
290 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.18 
 
 
463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  34.89 
 
 
283 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  34.31 
 
 
288 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  34.31 
 
 
288 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  34.31 
 
 
288 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  34.31 
 
 
288 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  34.31 
 
 
286 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  34.43 
 
 
286 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  34.43 
 
 
286 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  34.43 
 
 
286 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  34.43 
 
 
286 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  34.31 
 
 
288 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  34.43 
 
 
286 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.21 
 
 
292 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 
277 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  34.43 
 
 
286 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  34.43 
 
 
286 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
298 aa  158  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.51 
 
 
309 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  33.21 
 
 
288 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.7 
 
 
269 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  34.07 
 
 
286 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  33.72 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  34.09 
 
 
291 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
267 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 
502 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 
292 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2915  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 
287 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0347833  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  31.35 
 
 
285 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
288 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
291 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  34.47 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2823  MCP methyltransferase, CheR-type  32.85 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147208  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
293 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  36.33 
 
 
270 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
293 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2731  MCP methyltransferase, CheR-type  32.85 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.377322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  29.89 
 
 
285 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  29.89 
 
 
285 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  31.03 
 
 
271 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0159  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.21 
 
 
273 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  32.52 
 
 
289 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 
277 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  32.69 
 
 
275 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.64 
 
 
481 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  35.11 
 
 
283 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  29.12 
 
 
285 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.45 
 
 
275 aa  149  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  35.36 
 
 
295 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  31.37 
 
 
270 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  34.15 
 
 
280 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  34.43 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  34.01 
 
 
622 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  31.85 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  32.31 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  35.36 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  31.39 
 
 
272 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  32.03 
 
 
283 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  31.94 
 
 
285 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0207  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  33.21 
 
 
270 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  31.87 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  32.65 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>