More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2030 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  90.23 
 
 
481 aa  856    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  100 
 
 
481 aa  986    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  40.29 
 
 
502 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2707  MCP methyltransferase, CheR-type  39.8 
 
 
505 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1326  MCP methyltransferase, CheR-type  34.21 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.631295  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0330  MCP methyltransferase, CheR-type  34.86 
 
 
494 aa  276  8e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  33.12 
 
 
463 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  31.48 
 
 
468 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0992  MCP methyltransferase, CheR-type  30.75 
 
 
513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2370  protein-glutamate O-methyltransferase  32.46 
 
 
513 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470912  hitchhiker  0.000464427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  31.01 
 
 
478 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.65 
 
 
614 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0792  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.55 
 
 
527 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0766  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.74 
 
 
527 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.67 
 
 
611 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.16 
 
 
502 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  28.45 
 
 
622 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.39 
 
 
489 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.82 
 
 
289 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  30.8 
 
 
490 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2183  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  33.41 
 
 
514 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2652  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.74 
 
 
383 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
291 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 
280 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2402  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.54 
 
 
477 aa  163  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5450  MCP methyltransferase, CheR-type  31.58 
 
 
474 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1831  MCP methyltransferase, CheR-type  27.7 
 
 
515 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0652818  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  29.31 
 
 
499 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  30.66 
 
 
276 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  32.2 
 
 
291 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0649  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.49 
 
 
500 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  31.16 
 
 
283 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 
297 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  32.84 
 
 
980 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
277 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.58 
 
 
277 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  28.07 
 
 
486 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  31.76 
 
 
500 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 
276 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  27.27 
 
 
292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  30.95 
 
 
279 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  30.43 
 
 
327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  39.5 
 
 
485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0597  MCP methyltransferase, CheR-type  27.9 
 
 
481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  34.55 
 
 
277 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  31.54 
 
 
290 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  31.29 
 
 
274 aa  146  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  31.54 
 
 
290 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  31.89 
 
 
290 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0223  MCP methyltransferase, CheR-type  29.92 
 
 
492 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5115  protein-glutamate O-methyltransferase  28.23 
 
 
452 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466931  normal  0.0136698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  30.45 
 
 
271 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  28.26 
 
 
292 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2294  protein-glutamate O-methyltransferase  31.46 
 
 
468 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584163  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  29.86 
 
 
553 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  27.9 
 
 
291 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  31.27 
 
 
275 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  31.22 
 
 
500 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  30.45 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  33.06 
 
 
280 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.09 
 
 
1008 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  30.59 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  37.8 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  31.14 
 
 
283 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.4 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  27.85 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2836  protein-glutamate O-methyltransferase  39.5 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.235108  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2770  MCP methyltransferase, CheR-type  33.1 
 
 
490 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1196  MCP methyltransferase, CheR-type  34.12 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  34.87 
 
 
287 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 
285 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  32 
 
 
270 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1581  protein-glutamate O-methyltransferase  34.47 
 
 
269 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.175681  normal  0.125652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 
289 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3256  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 
488 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.941528  normal  0.0154039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  30.77 
 
 
277 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  34.73 
 
 
285 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  34.73 
 
 
285 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1767  MCP methyltransferase, CheR-type  32.63 
 
 
264 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0471  MCP methyltransferase, CheR-type  35.71 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  30.44 
 
 
513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  32.49 
 
 
291 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  30.5 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  32.49 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  30.33 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  30.73 
 
 
472 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2675  MCP methyltransferase, CheR-type  34.62 
 
 
488 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0343737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0456  protein-glutamate O-methyltransferase  36.25 
 
 
250 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  35.56 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  32.64 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  33.02 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  32.02 
 
 
289 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  32.94 
 
 
260 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  31.65 
 
 
291 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.87 
 
 
1371 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0961  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 
283 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.230734  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  30.65 
 
 
278 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  36.54 
 
 
414 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0259  protein-glutamate O-methyltransferase  29.8 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>