More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02206 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  100 
 
 		 466 aa  923    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  56.54 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  51.06 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  50.21 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  50.74 
 
 		 472 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  50.74 
 
 		 472 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  50.75 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  61.87 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  45.06 
 
 		 476 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  60.57 
 
 		 510 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  58.56 
 
 		 688 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  45.95 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  57.73 
 
 		 684 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  56.95 
 
 		 684 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  56.95 
 
 		 684 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  56.95 
 
 		 684 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  56.95 
 
 		 684 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  56.95 
 
 		 684 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  56.95 
 
 		 684 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  45.05 
 
 		 421 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  43.84 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  40.85 
 
 		 426 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  39.06 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  38.72 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  44.8 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  40.67 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.67 
 
 		 424 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  38.83 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.06 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.32 
 
 		 406 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.48 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  33.16 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.55 
 
 		 481 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  32.67 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.06 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.88 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  27.02 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 622 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.32 
 
 		 614 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  36.5 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  34.12 
 
 		 283 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  37.68 
 
 		 272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.18 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2652  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.64 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  33.7 
 
 		 298 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  33.65 
 
 		 270 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.43 
 
 		 281 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  35.2 
 
 		 289 aa  116  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  29.67 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  30.75 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  34.41 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.2 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  31.61 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  35.93 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 		 297 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  36.32 
 
 		 287 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.6 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0223  MCP methyltransferase, CheR-type  30.65 
 
 		 492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  31.01 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  33.94 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.89 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.44 
 
 		 611 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  31.86 
 
 		 283 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  31.97 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  36.14 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1700  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.08 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  34.11 
 
 		 291 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5450  MCP methyltransferase, CheR-type  31.76 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1732  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.93 
 
 		 260 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  34.65 
 
 		 295 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1522  chemotaxis protein methyltransferase  28.93 
 
 		 265 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1511  chemotaxis protein methyltransferase  28.93 
 
 		 265 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  34.5 
 
 		 296 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1551  MCP methyltransferase, CheR-type  29.44 
 
 		 260 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3646  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.08 
 
 		 260 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 		 288 aa  107  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  37.55 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  33.92 
 
 		 286 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  34.5 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  34.95 
 
 		 288 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  29.27 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5115  protein-glutamate O-methyltransferase  31.3 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466931  normal  0.0136698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1547  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.43 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2707  MCP methyltransferase, CheR-type  26.95 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1665  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.43 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  34.87 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 		 280 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  34.41 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  26.09 
 
 		 259 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  33.03 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  33.67 
 
 		 290 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  34.57 
 
 		 278 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  33.01 
 
 		 288 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  32.52 
 
 		 288 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  31.98 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>