More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1495 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  100 
 
 
426 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  86.45 
 
 
426 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  62.92 
 
 
425 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  60.82 
 
 
414 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  57.87 
 
 
424 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  56.68 
 
 
421 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  57.35 
 
 
424 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  56.39 
 
 
424 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  56.13 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  43.01 
 
 
476 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  46.14 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  44.26 
 
 
429 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.68 
 
 
472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  39.04 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  38.27 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  38.67 
 
 
479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  39.75 
 
 
472 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.75 
 
 
472 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  39.87 
 
 
470 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  36.34 
 
 
406 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.29 
 
 
406 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  41.61 
 
 
510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  44.1 
 
 
684 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  44.1 
 
 
684 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  44.1 
 
 
684 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  44.1 
 
 
684 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  44.1 
 
 
684 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  44.1 
 
 
684 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  44.1 
 
 
684 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  44.1 
 
 
688 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  44.2 
 
 
520 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.3 
 
 
431 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  34.89 
 
 
417 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  29.21 
 
 
622 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.96 
 
 
289 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  32.04 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  40.21 
 
 
283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  32.59 
 
 
291 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  39.18 
 
 
295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.85 
 
 
614 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  29.56 
 
 
463 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 
288 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  34.65 
 
 
288 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.37 
 
 
481 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  27.96 
 
 
478 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.45 
 
 
284 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  32.46 
 
 
283 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  31.2 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  30 
 
 
499 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  34.08 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  31.54 
 
 
298 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  31.35 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  37.7 
 
 
271 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  34.68 
 
 
290 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  31.05 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  31.92 
 
 
295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.43 
 
 
481 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  29.37 
 
 
283 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.34 
 
 
611 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  32.91 
 
 
289 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  29.84 
 
 
271 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  30.53 
 
 
277 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.8 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  30.88 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  31.96 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  29.23 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0330  MCP methyltransferase, CheR-type  28.07 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  31.81 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2294  protein-glutamate O-methyltransferase  31.29 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584163  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  30.04 
 
 
1010 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
285 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2370  protein-glutamate O-methyltransferase  29.64 
 
 
513 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470912  hitchhiker  0.000464427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  32.1 
 
 
297 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  29.74 
 
 
271 aa  113  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  33.85 
 
 
414 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  27.82 
 
 
468 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  32.1 
 
 
297 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  33.74 
 
 
286 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  32.56 
 
 
303 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  31.98 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  33.74 
 
 
286 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  33.74 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  28.74 
 
 
475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  33.74 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  27.6 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  33.74 
 
 
286 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  33.74 
 
 
286 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  33.74 
 
 
286 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  29.97 
 
 
502 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  31.86 
 
 
486 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0649  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.63 
 
 
500 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0961  MCP methyltransferase, CheR-type  29.36 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.230734  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  31.4 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  33.33 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  28.79 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  28.28 
 
 
490 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>