More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4128 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 414 aa  836    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  74.3 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  73.6 
 
 		 424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  71.17 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  60.56 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  58.37 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  60.19 
 
 		 426 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  52.98 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  50.83 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  40.99 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  43.66 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  44.5 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.88 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  41.24 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  40 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  40.43 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  40.43 
 
 		 472 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.34 
 
 		 470 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  38.46 
 
 		 479 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.06 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.57 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  45.49 
 
 		 684 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.67 
 
 		 688 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.22 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  41.74 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  33.41 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  32.92 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 622 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  31.81 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.57 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.28 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  30.61 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0360  MCP methyltransferase, CheR-type  31.43 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.86 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  30.89 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  32.89 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.79 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  32.89 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  29.51 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  29.87 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  30.5 
 
 		 298 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  33.49 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  29.12 
 
 		 475 aa  109  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  31.08 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.34 
 
 		 614 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  32.8 
 
 		 259 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.61 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  32.06 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.86 
 
 		 1499 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  28.98 
 
 		 276 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  27.6 
 
 		 502 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  31.56 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1222 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  28.74 
 
 		 283 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  31.55 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  27.85 
 
 		 1378 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.08 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  31.33 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  31.71 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  32.26 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.85 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  31.4 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  31.2 
 
 		 295 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  31.15 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5450  MCP methyltransferase, CheR-type  29.22 
 
 		 474 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  27.47 
 
 		 297 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  28.93 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  29.67 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  27.87 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  30.28 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  29.03 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  31.49 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  28.04 
 
 		 490 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  29.76 
 
 		 283 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  34.38 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  28.69 
 
 		 276 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  33.69 
 
 		 267 aa  99.8  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 294 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  27.51 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  31.93 
 
 		 285 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2836  protein-glutamate O-methyltransferase  30.87 
 
 		 485 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.235108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.04 
 
 		 1348 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0835  Protein-glutamate O-methyltransferase  28.33 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  34.9 
 
 		 283 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.88 
 
 		 611 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  31.09 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  31.09 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5115  protein-glutamate O-methyltransferase  27.68 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466931  normal  0.0136698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  33.98 
 
 		 269 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  31.37 
 
 		 298 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>