More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4232 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  97.41 
 
 		 424 aa  787    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  91.98 
 
 		 424 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 		 424 aa  845    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  75 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  62.33 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  58.24 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  58.35 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  52.91 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  53.35 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  41.13 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  45.26 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  41.03 
 
 		 472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  44.73 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  38.88 
 
 		 479 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  41.26 
 
 		 466 aa  269  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.13 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  40.13 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  40.13 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.61 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.12 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  33.41 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.9 
 
 		 688 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  45 
 
 		 510 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  45.68 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  45.13 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  46.07 
 
 		 684 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  37.01 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 622 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  33.16 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  30.5 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  31.9 
 
 		 475 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.88 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.3 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.89 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0360  MCP methyltransferase, CheR-type  30.75 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  33.7 
 
 		 499 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  31.02 
 
 		 291 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  37.13 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  37.81 
 
 		 283 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  31.41 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  32.59 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  36.14 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  32.14 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  33.01 
 
 		 277 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.43 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.7 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  27.84 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  28.51 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  35.07 
 
 		 283 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  34.01 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 		 259 aa  114  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  30.49 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  29.53 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.23 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  30.89 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  34 
 
 		 295 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5450  MCP methyltransferase, CheR-type  29.79 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1604  MCP methyltransferase, CheR-type  26.94 
 
 		 260 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.52 
 
 		 1499 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  34.87 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.77 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  30.99 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  30.62 
 
 		 270 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  35.1 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.39 
 
 		 292 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  32.2 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  30.24 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  30.07 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  29.25 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  30.74 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  31.92 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0330  MCP methyltransferase, CheR-type  25.54 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 		 285 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  31.73 
 
 		 289 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0835  Protein-glutamate O-methyltransferase  30.47 
 
 		 280 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  29.8 
 
 		 284 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  28.43 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.02 
 
 		 611 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  33.61 
 
 		 285 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  33.61 
 
 		 285 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.59 
 
 		 280 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  32.99 
 
 		 500 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  25 
 
 		 478 aa  106  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  30.68 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5115  protein-glutamate O-methyltransferase  27.68 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466931  normal  0.0136698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  32.78 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0649  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.12 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  31.86 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  35.04 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  29.39 
 
 		 292 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  27.08 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  31.51 
 
 		 292 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>