More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3977 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  100 
 
 
476 aa  964    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  46.64 
 
 
472 aa  349  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  45.11 
 
 
470 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  45.06 
 
 
466 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  44.03 
 
 
470 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  44.84 
 
 
472 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  44.84 
 
 
472 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  43.1 
 
 
479 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  43.17 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  42.46 
 
 
426 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  40.99 
 
 
414 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  42.12 
 
 
424 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  42.3 
 
 
422 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  41.01 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  52.14 
 
 
684 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  51.79 
 
 
684 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  51.79 
 
 
684 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  51.79 
 
 
684 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  51.79 
 
 
684 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  51.79 
 
 
684 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  51.79 
 
 
684 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  51.81 
 
 
688 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  51.09 
 
 
510 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  51.1 
 
 
520 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  51.15 
 
 
424 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  49.05 
 
 
426 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  50.37 
 
 
416 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.59 
 
 
431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.47 
 
 
406 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.82 
 
 
406 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  31.52 
 
 
270 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  30.06 
 
 
463 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  27.9 
 
 
478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  32.19 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  30.63 
 
 
277 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  27.03 
 
 
622 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  31.02 
 
 
468 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  30.56 
 
 
292 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  32.46 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.88 
 
 
289 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.12 
 
 
614 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.34 
 
 
284 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  29.76 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  31.23 
 
 
291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.63 
 
 
481 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  31.37 
 
 
283 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  37.5 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.89 
 
 
291 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  38.3 
 
 
295 aa  113  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  30.71 
 
 
618 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  39.36 
 
 
283 aa  113  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  29.82 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  31.14 
 
 
288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  32.4 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0835  Protein-glutamate O-methyltransferase  28.39 
 
 
280 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  32.22 
 
 
414 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.07 
 
 
291 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  33.08 
 
 
481 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.86 
 
 
489 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  25.56 
 
 
259 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  34.98 
 
 
289 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  29.18 
 
 
290 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  31.72 
 
 
277 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  28.03 
 
 
264 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  34.74 
 
 
278 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  27.12 
 
 
513 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  27.6 
 
 
283 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  27.38 
 
 
281 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  30.4 
 
 
267 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  29.37 
 
 
285 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  32.49 
 
 
301 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 
284 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  29.53 
 
 
291 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  30.34 
 
 
271 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  27.73 
 
 
259 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  29.84 
 
 
284 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.02 
 
 
276 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  31.77 
 
 
301 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  34.63 
 
 
272 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  35.26 
 
 
275 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2707  MCP methyltransferase, CheR-type  27.83 
 
 
505 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  27.05 
 
 
490 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  30.16 
 
 
280 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
500 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5115  protein-glutamate O-methyltransferase  31.7 
 
 
452 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466931  normal  0.0136698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  28.21 
 
 
271 aa  103  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  36.02 
 
 
290 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0725  protein-glutamate O-methyltransferase  31.68 
 
 
291 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  37.24 
 
 
274 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  29.65 
 
 
499 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  25.94 
 
 
502 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  32.16 
 
 
291 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.77 
 
 
281 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  33.63 
 
 
285 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  27.61 
 
 
276 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2652  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  41.45 
 
 
383 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  36.92 
 
 
303 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  32.81 
 
 
280 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  29.13 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>