More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1054 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
425 aa  866    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  61.52 
 
 
426 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  61.54 
 
 
426 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  62.21 
 
 
424 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  60.56 
 
 
414 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  60.32 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  60.31 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  57.18 
 
 
421 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  57.52 
 
 
422 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  46.23 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  42.49 
 
 
476 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  47.02 
 
 
429 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.41 
 
 
472 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  39.83 
 
 
470 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  39.08 
 
 
479 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  39.32 
 
 
470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  39.28 
 
 
472 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  39.28 
 
 
472 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  39.51 
 
 
466 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.18 
 
 
406 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.94 
 
 
406 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.32 
 
 
684 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  45.32 
 
 
684 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.32 
 
 
684 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.32 
 
 
684 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.32 
 
 
684 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.32 
 
 
684 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  45.32 
 
 
684 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  45.16 
 
 
688 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  40.74 
 
 
510 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  40.49 
 
 
520 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.45 
 
 
431 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  31.71 
 
 
417 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  28.92 
 
 
622 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.2 
 
 
489 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  32.51 
 
 
291 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  32.16 
 
 
492 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.96 
 
 
289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  26.79 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  34.1 
 
 
288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  28.15 
 
 
468 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  32.92 
 
 
291 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  29.29 
 
 
475 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.78 
 
 
1499 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.02 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  31.28 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  30.42 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  32.88 
 
 
283 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  29.85 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  30.86 
 
 
1378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  29.91 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  31.88 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  32.46 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1547  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.21 
 
 
265 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1665  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.21 
 
 
260 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5175  MCP methyltransferase, CheR-type  27.94 
 
 
823 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  30.25 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.39 
 
 
1348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  31.53 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  30.45 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  31.3 
 
 
276 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1522  chemotaxis protein methyltransferase  27.35 
 
 
265 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1511  chemotaxis protein methyltransferase  27.35 
 
 
265 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  29.64 
 
 
980 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1732  chemotaxis protein methyltransferase CheR  27.35 
 
 
260 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5450  MCP methyltransferase, CheR-type  30.37 
 
 
474 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  36.08 
 
 
283 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  35.05 
 
 
295 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0360  MCP methyltransferase, CheR-type  30.31 
 
 
436 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  32.64 
 
 
285 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 
285 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.56 
 
 
614 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.9 
 
 
481 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  27.69 
 
 
617 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.36 
 
 
281 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  31.65 
 
 
289 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2051  MCP methyltransferase, CheR-type  33.05 
 
 
299 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  hitchhiker  0.000266106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  29.8 
 
 
290 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.58 
 
 
1190 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1700  chemotaxis protein methyltransferase CheR  26.92 
 
 
260 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1344 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  27.38 
 
 
302 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  31.71 
 
 
288 aa  106  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  30.73 
 
 
1200 aa  106  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1222 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  31.05 
 
 
267 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3646  chemotaxis protein methyltransferase CheR  26.92 
 
 
260 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0835  Protein-glutamate O-methyltransferase  26.46 
 
 
280 aa  106  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1810  chemotaxis protein methyltransferase CheR  26.92 
 
 
260 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  32.22 
 
 
285 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  32.11 
 
 
303 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  29.5 
 
 
490 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  30.71 
 
 
500 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  28.15 
 
 
298 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  31.6 
 
 
274 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  31.71 
 
 
288 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1754  chemotaxis protein methyltransferase CheR  26.92 
 
 
260 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  27.59 
 
 
276 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  31.71 
 
 
288 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>