More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3971 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  100 
 
 
429 aa  860    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  59 
 
 
416 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  47.85 
 
 
425 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  50.24 
 
 
421 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  50.12 
 
 
422 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  43.86 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  44.39 
 
 
426 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  46.96 
 
 
424 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  45.9 
 
 
424 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  45.39 
 
 
472 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  46 
 
 
414 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  42.67 
 
 
476 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  44.8 
 
 
466 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  42.76 
 
 
470 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  43.4 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  42.16 
 
 
479 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  37.32 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  42.8 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  42.58 
 
 
472 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  42.58 
 
 
472 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  36.36 
 
 
406 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  36.36 
 
 
406 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.81 
 
 
688 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  47.1 
 
 
684 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.01 
 
 
684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.01 
 
 
684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.01 
 
 
684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.01 
 
 
684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  46.01 
 
 
684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  46.01 
 
 
684 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  46.3 
 
 
510 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  46.67 
 
 
520 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  34.34 
 
 
417 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.21 
 
 
463 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  32.89 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5450  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  35.68 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  34.17 
 
 
290 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  28.87 
 
 
622 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  35.63 
 
 
286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2183  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.45 
 
 
514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  34.94 
 
 
288 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.34 
 
 
284 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  35.63 
 
 
286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  35.63 
 
 
286 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  34.94 
 
 
288 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  35.63 
 
 
286 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  34.94 
 
 
288 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  35.63 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  35.63 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  35.63 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  35.63 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  34.54 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  34.54 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  35.48 
 
 
286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  31.35 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  34.73 
 
 
274 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2652  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  33.11 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  27.78 
 
 
502 aa  114  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  31.62 
 
 
285 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  30.71 
 
 
292 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  34.54 
 
 
288 aa  113  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.58 
 
 
1361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  31.02 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  27.05 
 
 
481 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  30.71 
 
 
284 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  29.88 
 
 
502 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.98 
 
 
614 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.35 
 
 
291 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 
296 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  29.73 
 
 
270 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  31.98 
 
 
327 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.55 
 
 
1384 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0360  MCP methyltransferase, CheR-type  30.89 
 
 
436 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.17 
 
 
289 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  34.39 
 
 
295 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  33.68 
 
 
259 aa  106  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  34.39 
 
 
272 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  30.2 
 
 
292 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  31.89 
 
 
284 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  33.33 
 
 
290 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  30.04 
 
 
290 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  29.88 
 
 
271 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0433  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.34 
 
 
618 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.95 
 
 
611 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  34.39 
 
 
272 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  29.05 
 
 
276 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  28.3 
 
 
277 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  32.31 
 
 
283 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  34.18 
 
 
291 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  30.12 
 
 
490 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  34.01 
 
 
275 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  33.22 
 
 
303 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 
303 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  30.92 
 
 
291 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  32.17 
 
 
291 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  29.08 
 
 
309 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  28.46 
 
 
285 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  29.13 
 
 
283 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  30.83 
 
 
297 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>