More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2379 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  90.72 
 
 		 611 aa  1060    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  100 
 
 		 614 aa  1247    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 622 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2370  protein-glutamate O-methyltransferase  35.46 
 
 		 513 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470912  hitchhiker  0.000464427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1326  MCP methyltransferase, CheR-type  33.12 
 
 		 498 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.631295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  33.82 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  32.92 
 
 		 490 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  32.87 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  34.49 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.17 
 
 		 481 aa  200  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2707  MCP methyltransferase, CheR-type  31.5 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  29.84 
 
 		 481 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0766  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.18 
 
 		 527 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0792  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  26.52 
 
 		 527 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2954  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30.08 
 
 		 489 aa  173  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  29.65 
 
 		 478 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  36.84 
 
 		 291 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.06 
 
 		 289 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  36.63 
 
 		 283 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2402  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.93 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  32.86 
 
 		 553 aa  164  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 		 292 aa  163  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.92 
 
 		 309 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.94 
 
 		 291 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  37.25 
 
 		 280 aa  161  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  35.56 
 
 		 297 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0649  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  32.27 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0330  MCP methyltransferase, CheR-type  30.61 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.77 
 
 		 281 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0223  MCP methyltransferase, CheR-type  32.72 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.88 
 
 		 277 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0640  MCP methyltransferase, CheR-type  31.96 
 
 		 500 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  33.56 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  33.21 
 
 		 292 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0992  MCP methyltransferase, CheR-type  28.75 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  34.75 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3075  MCP methyltransferase, CheR-type  30.69 
 
 		 475 aa  153  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54871  hitchhiker  0.00801786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  33.58 
 
 		 291 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0615  MCP methyltransferase, CheR-type  32.27 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 		 288 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  32.22 
 
 		 499 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0728  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.08 
 
 		 486 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1831  MCP methyltransferase, CheR-type  26.07 
 
 		 515 aa  150  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0652818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.59 
 
 		 284 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 		 279 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  34.85 
 
 		 270 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.35 
 
 		 277 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  30.77 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  33.45 
 
 		 290 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  33.45 
 
 		 290 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2183  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  32.59 
 
 		 514 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  38.97 
 
 		 302 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  32.84 
 
 		 271 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 		 285 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  37.74 
 
 		 305 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  34.14 
 
 		 275 aa  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  31.41 
 
 		 417 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 		 283 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0833  MCP methyltransferase, CheR-type  34.59 
 
 		 260 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  31.7 
 
 		 276 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  37.65 
 
 		 305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  36.69 
 
 		 302 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2294  protein-glutamate O-methyltransferase  30.86 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0597  MCP methyltransferase, CheR-type  29.48 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  32.95 
 
 		 327 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  35.94 
 
 		 271 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  33.57 
 
 		 298 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  29.86 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.2 
 
 		 288 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  37.67 
 
 		 298 aa  137  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  35.74 
 
 		 298 aa  136  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  35.87 
 
 		 292 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  33.47 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  31.86 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.88 
 
 		 1167 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 		 301 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 		 472 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 		 472 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  34.73 
 
 		 264 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0416  chemotaxis protein methyltransferase  32.7 
 
 		 285 aa  134  3.9999999999999996e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.783247  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.69 
 
 		 1445 aa  134  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  33.6 
 
 		 277 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5115  protein-glutamate O-methyltransferase  28.37 
 
 		 452 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.466931  normal  0.0136698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  30.63 
 
 		 259 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  35.34 
 
 		 277 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  34.32 
 
 		 301 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0975  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 		 281 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 		 1160 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 		 318 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  32.59 
 
 		 267 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  31.46 
 
 		 300 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  33.71 
 
 		 258 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  36.19 
 
 		 303 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1727  MCP methyltransferase, CheR-type  31.32 
 
 		 265 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.04 
 
 		 1218 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  33.92 
 
 		 290 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  33.2 
 
 		 280 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 421 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>