More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5515 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3681  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  89.04 
 
 		 510 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4575  MCP methyltransferase, CheR-type  73.27 
 
 		 472 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3735  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  73.11 
 
 		 470 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4944  MCP methyltransferase  69.35 
 
 		 479 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.102677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5515  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 520 aa  1017    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201432  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  73.27 
 
 		 472 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157072  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  85.29 
 
 		 470 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2685  CheR methyltransferase family protein  67.86 
 
 		 684 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0503  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  66.67 
 
 		 688 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0219  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  67.14 
 
 		 684 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0966  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  67.14 
 
 		 684 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0256  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  67.14 
 
 		 684 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2540  CheR methyltransferase family protein  67.14 
 
 		 684 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1597  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  67.14 
 
 		 684 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1400  CheR methyltransferase SAM binding/TPR domain-containing protein  67.14 
 
 		 684 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02206  putative methyltransferase protein  44.89 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5393  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  52.99 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.378929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1431  putative methyltransferase  44.59 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3977  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  43.28 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16450  putative methyltransferase  44.91 
 
 		 422 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1305  protein-glutamate O-methyltransferase  44.27 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1054  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3651  MCP methyltransferase, CheR-type  51.82 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1490  methyltransferase, CheR-like  43.9 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00772145  normal  0.942739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1095  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  46.29 
 
 		 424 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323093  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1495  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  44.57 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4128  MCP methyltransferase, CheR-type  41.57 
 
 		 414 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4232  protein-glutamate O-methyltransferase  45 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3971  putative chemotaxis MCP methyltransferase CheR-type  46.52 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000407397  hitchhiker  0.00492524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  35.56 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  28.21 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  37.23 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0829  CheR family methyltransferase  41.23 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  36.32 
 
 		 277 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  36.32 
 
 		 270 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  34.74 
 
 		 490 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.63 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  39.11 
 
 		 289 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2691  protein-glutamate O-methyltransferase  35.02 
 
 		 298 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  36.54 
 
 		 289 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  37.62 
 
 		 285 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  37.62 
 
 		 285 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 		 285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2189  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.82 
 
 		 481 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2379  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.42 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  36.82 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0466  protein-glutamate O-methyltransferase  32.15 
 
 		 492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  33.81 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2402  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  38.05 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  35.25 
 
 		 274 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  35.26 
 
 		 292 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  37.62 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1839  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  33.93 
 
 		 611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  35.55 
 
 		 283 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  29.77 
 
 		 258 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1940  MCP methyltransferase, CheR-type  32.5 
 
 		 259 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  33.99 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.9 
 
 		 289 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  33.99 
 
 		 283 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  32.68 
 
 		 291 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  36.13 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4203  MCP methyltransferase, CheR-type  34.74 
 
 		 264 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0106813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.49 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.24 
 
 		 284 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1732  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.98 
 
 		 260 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  36.29 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1700  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.2 
 
 		 260 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  31.71 
 
 		 291 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  31.64 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1551  MCP methyltransferase, CheR-type  31.49 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.742709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  32.62 
 
 		 290 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  32.9 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  32.18 
 
 		 280 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  32.77 
 
 		 288 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0766  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  22.03 
 
 		 527 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  36.32 
 
 		 288 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  35.79 
 
 		 292 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  33.08 
 
 		 277 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3646  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.71 
 
 		 260 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1522  chemotaxis protein methyltransferase  32.46 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1511  chemotaxis protein methyltransferase  32.46 
 
 		 265 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  35.27 
 
 		 283 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  35.15 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  34.67 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.56 
 
 		 1499 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  31.32 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  35.64 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  36.59 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  35.35 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  36.32 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.2 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0255  putative chemotaxis protein methyltransferase  34.91 
 
 		 280 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  36.95 
 
 		 290 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02200  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.81 
 
 		 280 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.077708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2362  MCP methyltransferase, CheR-type  26.06 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>