More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0407 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0407  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 
286 aa  584  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05380  methyltransferase PilK  72.13 
 
 
291 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0512  methyltransferase PilK  71.43 
 
 
291 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3771  protein-glutamate O-methyltransferase  51.06 
 
 
299 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3630  protein-glutamate O-methyltransferase  46.26 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.311098  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0127  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 
282 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.46 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 
271 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  36.51 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  34.8 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  36.19 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  32.84 
 
 
289 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  33.86 
 
 
273 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  32.56 
 
 
283 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  30.59 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  33.95 
 
 
278 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  34.26 
 
 
288 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 
275 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  33.58 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  32.58 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  32.2 
 
 
301 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  33.86 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  29.12 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  33.07 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  32.67 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  31.5 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  31.34 
 
 
284 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  33.07 
 
 
288 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  33.07 
 
 
288 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  33.07 
 
 
288 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  31.82 
 
 
299 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  33.07 
 
 
288 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  33.07 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  31.71 
 
 
275 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  28.4 
 
 
272 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  32.27 
 
 
286 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  33.72 
 
 
297 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  32.27 
 
 
286 aa  132  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  27.86 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  34.47 
 
 
302 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  35.19 
 
 
303 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  32.27 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  32.81 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  32.73 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  30.97 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  30.83 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  32.27 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  32.27 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  32.27 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  36.43 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0659  protein-glutamate O-methyltransferase  34.23 
 
 
499 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  29.53 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  32.27 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.73 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  33.33 
 
 
274 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  29.88 
 
 
300 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  32.02 
 
 
283 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  32.94 
 
 
295 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  31.62 
 
 
309 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  29.25 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.16 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  30.65 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  31.33 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  32.31 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  31.03 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  36.06 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  35.29 
 
 
502 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  32.64 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  32.67 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  30.65 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  30.65 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  26.89 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.81 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.77 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  32.57 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  30.77 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  30.65 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  31.45 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  30.95 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.33 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
295 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  32.81 
 
 
315 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  32.81 
 
 
314 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  34.12 
 
 
269 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  27.54 
 
 
283 aa  127  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  30.48 
 
 
299 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  30.47 
 
 
276 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.84 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  29.64 
 
 
277 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0364  protein-glutamate O-methyltransferase  30.77 
 
 
270 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.171706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  32.54 
 
 
297 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0033  protein-glutamate O-methyltransferase  35.18 
 
 
490 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.41 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.41 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  32.41 
 
 
314 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  32.32 
 
 
275 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  27.88 
 
 
274 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>