More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3630 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3630  protein-glutamate O-methyltransferase  100 
 
 
282 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.311098  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05380  methyltransferase PilK  48.04 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0512  methyltransferase PilK  48.04 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0407  protein-glutamate O-methyltransferase  46.26 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3771  protein-glutamate O-methyltransferase  46.04 
 
 
299 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0127  MCP methyltransferase, CheR-type  38.35 
 
 
282 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  31.13 
 
 
271 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  32.05 
 
 
281 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  31.01 
 
 
283 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  35.43 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  29.01 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  35.43 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  27.06 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  35.43 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  33.2 
 
 
271 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  33.98 
 
 
291 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  30.94 
 
 
297 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  31.42 
 
 
280 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  35.43 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  35.43 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  35.43 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  35.43 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  35.43 
 
 
286 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  28.94 
 
 
289 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.85 
 
 
292 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  30.5 
 
 
309 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  31.16 
 
 
299 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0625  MCP methyltransferase, CheR-type  30.04 
 
 
290 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  34.65 
 
 
286 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  31.12 
 
 
280 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  28.19 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1199  methylase of chemotaxis methyl-accepting protein, CheR-like  32.3 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  29.32 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  30.22 
 
 
270 aa  132  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  31 
 
 
275 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.36 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  28.15 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  29.59 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  29.23 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  30.35 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  28.15 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  32.41 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  32.41 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  29.54 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  27.1 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  32.41 
 
 
288 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0808  MCP methyltransferase, CheR-type  27.73 
 
 
272 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  32.41 
 
 
288 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  32.41 
 
 
288 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
553 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  29.21 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0725  protein-glutamate O-methyltransferase  28.63 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3469  MCP methyltransferase, CheR-type  31.78 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.912759  normal  0.640591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  33.71 
 
 
275 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  32.14 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  30.31 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1330  protein-glutamate O-methyltransferase  29.54 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  28 
 
 
277 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  32.41 
 
 
288 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  31.75 
 
 
290 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0862  MCP methyltransferase, CheR-type  30.23 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  29.46 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.25 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  26.15 
 
 
292 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  31.02 
 
 
269 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  27.38 
 
 
283 aa  125  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  32.58 
 
 
302 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  30.4 
 
 
269 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  32.14 
 
 
290 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
276 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2146  MCP methyltransferase, CheR-type  31.87 
 
 
271 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  28.63 
 
 
275 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  29.6 
 
 
271 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  32.23 
 
 
268 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2571  MCP methyltransferase, CheR-type  29.82 
 
 
303 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1382  MCP methyltransferase, CheR-type  30.11 
 
 
303 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  32.57 
 
 
301 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3212  MCP methyltransferase, CheR-type  28.85 
 
 
291 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409906  hitchhiker  0.0000000000690371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  25.8 
 
 
327 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2475  MCP methyltransferase, CheR-type  29.82 
 
 
303 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  31.75 
 
 
290 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  28.46 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  29.12 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  28.68 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  30.74 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  32.43 
 
 
301 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.57 
 
 
1499 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  29.81 
 
 
286 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  28.74 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  31.35 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  27.73 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  31.35 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  31.35 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  26.29 
 
 
269 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.19 
 
 
1384 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  28.84 
 
 
291 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4209  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  30.95 
 
 
502 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135133  normal  0.0700485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  28.63 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  28.63 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>