More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2716 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  100 
 
 		 905 aa  1826    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 878 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.59 
 
 		 810 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.52 
 
 		 2240 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.17 
 
 		 1737 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 3035 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.98 
 
 		 887 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  21.25 
 
 		 1213 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.03 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 		 1161 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 1486 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 620 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  20.83 
 
 		 573 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1676 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 1069 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  20.88 
 
 		 620 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  17.89 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 808 aa  72.4  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.38 
 
 		 266 aa  72  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.07 
 
 		 689 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  18.71 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3145 aa  71.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.38 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 927 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.83 
 
 		 1694 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 860 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.35 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21 
 
 		 883 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 1276 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  18.32 
 
 		 4079 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  19.71 
 
 		 782 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 		 632 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  22.05 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 632 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  20.76 
 
 		 614 aa  67  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.5 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 597 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.98 
 
 		 681 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  21.79 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  18.53 
 
 		 1406 aa  65.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.85 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  25.99 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 827 aa  65.1  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  18.84 
 
 		 935 aa  64.7  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 		 2059 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  18.57 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.9 
 
 		 587 aa  64.3  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 615 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 1979 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  16.8 
 
 		 818 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.22 
 
 		 4489 aa  64.3  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 323 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  18.93 
 
 		 988 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  24.64 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.29 
 
 		 1297 aa  62.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.25 
 
 		 979 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 3172 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 364 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.69 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.54 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  20.24 
 
 		 955 aa  62  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.09 
 
 		 557 aa  62  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.61 
 
 		 1067 aa  62  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 568 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.43 
 
 		 730 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.22 
 
 		 865 aa  61.6  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.98 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.73 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.29 
 
 		 293 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 635 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 		 639 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 		 522 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 635 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  20.69 
 
 		 391 aa  60.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.17 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  21.29 
 
 		 622 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 208 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>