14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3530 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  71.98 
 
 		 268 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  73.54 
 
 		 257 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  66.79 
 
 		 261 aa  325  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  54.3 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  55.25 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57640  hypothetical protein  33.64 
 
 		 320 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5009  hypothetical protein  33.18 
 
 		 320 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0896  hypothetical protein  32.87 
 
 		 320 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  35.85 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  33.02 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  30.84 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  26.42 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>