100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0204 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 110 aa  215  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  64.15 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  60.19 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  55.88 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  57 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  52.88 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  51.96 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  50.94 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  53.47 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  52.48 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  52.48 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  42.45 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  43.81 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  46.55 
 
 		 620 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  31.87 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 636 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 718 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 		 620 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 612 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 615 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.76 
 
 		 560 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  31.17 
 
 		 652 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.33 
 
 		 461 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.52 
 
 		 764 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 410 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 595 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 		 626 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 637 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 391 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 715 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  27.37 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  41.67 
 
 		 703 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 		 442 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 		 810 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 635 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 878 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 611 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 635 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 622 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.99 
 
 		 614 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.99 
 
 		 614 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 614 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.99 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 614 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 4079 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.99 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 639 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 614 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 433 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 587 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 		 1067 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  27.52 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 927 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 593 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 638 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 1121 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 243 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 632 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 828 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 436 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.76 
 
 		 725 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  26.09 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  38.24 
 
 		 559 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 605 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 589 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 586 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  32.88 
 
 		 661 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  42.42 
 
 		 720 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.05 
 
 		 864 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 591 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 733 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  43.33 
 
 		 789 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3096  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0496806  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 638 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1003  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 251 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 626 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 1049 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4512  protein of unknown function DUF124  32.97 
 
 		 533 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 828 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3488  DnaJ-like protein  30.16 
 
 		 104 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.471685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2688  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 		 301 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1094 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.85 
 
 		 1154 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>