55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2454 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
326 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  85.66 
 
 
292 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  61.13 
 
 
317 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  53.21 
 
 
339 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  44.51 
 
 
332 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  46.15 
 
 
342 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  41.37 
 
 
337 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  47.44 
 
 
312 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  47.86 
 
 
317 aa  222  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  44.81 
 
 
330 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
310 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  36.68 
 
 
322 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  40.37 
 
 
314 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20370  hypothetical protein  57.31 
 
 
172 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  39.39 
 
 
347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  36.15 
 
 
308 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3525  hypothetical protein  39.34 
 
 
244 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  0.214556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3703  hypothetical protein  39.62 
 
 
224 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1948  hypothetical protein  37.79 
 
 
267 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168356  hitchhiker  0.000258843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2693  hypothetical protein  38.07 
 
 
231 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2447  hypothetical protein  38.07 
 
 
244 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.779936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3246  hypothetical protein  37.56 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310754  normal  0.875608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2426  hypothetical protein  37.67 
 
 
231 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  32.77 
 
 
188 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1468  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  33.33 
 
 
164 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  29.31 
 
 
199 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36889  predicted protein  33.33 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00688126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  20.14 
 
 
164 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  32.04 
 
 
563 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
565 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.95 
 
 
725 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
265 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.32 
 
 
622 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
822 aa  45.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.32 
 
 
764 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 
607 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  30.36 
 
 
1717 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
607 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
607 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
607 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.36 
 
 
1067 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  31.36 
 
 
748 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
607 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
700 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  34.78 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1490  peptidase C39, bacteriocin processing  26.35 
 
 
199 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161364  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1461  tetratricopeptide TPR_2  35.23 
 
 
194 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
681 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
1049 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
280 aa  42.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>