33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5430 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  234  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  44.23 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  44.23 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  44.23 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  43.27 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  40.21 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  39 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  37.78 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 318 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  32.61 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  28.89 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  28.92 
 
 		 542 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  26.37 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 638 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.88 
 
 		 887 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  26.37 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.59 
 
 		 622 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  25.32 
 
 		 2679 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.32 
 
 		 764 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 685 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 511 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>