15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0714 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  50.93 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  48.51 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  42.57 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  32.67 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  32.67 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  31.37 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  31.03 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  36.99 
 
 		 577 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>