25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3761 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  46.32 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  40.82 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  39.6 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  39 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  36.08 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  36.08 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  35.05 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  30.69 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  30.61 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.65 
 
 		 924 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 718 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 3172 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  25.51 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 3301 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 589 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 3145 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 645 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>