102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3633 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  96.4 
 
 		 111 aa  214  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  74.31 
 
 		 109 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  44.23 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  39.39 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  38.54 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  36.79 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  36.08 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  32.67 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 539 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 362 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 540 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 864 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  29.67 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 313 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 622 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.46 
 
 		 764 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  29.67 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 620 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 685 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 1450 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 269 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  26.04 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.41 
 
 		 887 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 657 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.69 
 
 		 620 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 615 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 448 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 649 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 649 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 639 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 681 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 436 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  30.43 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.95 
 
 		 626 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 614 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 614 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 2262 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.78 
 
 		 865 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.92 
 
 		 816 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 909 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.88 
 
 		 725 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 646 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 587 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 766 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 636 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 612 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  37.84 
 
 		 572 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 637 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  37.66 
 
 		 677 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 1061 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  32.88 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 878 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.11 
 
 		 810 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 		 626 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 		 614 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 		 614 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 614 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 632 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.1 
 
 		 585 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  32.61 
 
 		 398 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 611 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 635 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 1486 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 635 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 594 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 714 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1094 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.78 
 
 		 807 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 739 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 637 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.33 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 566 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.95 
 
 		 603 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1406 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 2262 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 567 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 754 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.32 
 
 		 737 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 811 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>