31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1242 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
103 aa  204  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  41.18 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  34.65 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  36.27 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  31.37 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  32.32 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  32.32 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  37.62 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 
111 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  34.57 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  34 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  31.31 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
112 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
190 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2536  tetratricopeptide TPR_2  34.78 
 
 
93 aa  40  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.949555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>