37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2058 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  45.26 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  46.32 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1239  hypothetical protein  44.12 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.292653  normal  0.0234659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  36.96 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  36.84 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  28.72 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 318 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2536  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.949555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 949 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1127 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 264 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 395 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.74 
 
 		 602 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 605 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 900 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1404 aa  41.6  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  34.85 
 
 		 538 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.76 
 
 		 436 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  29.25 
 
 		 420 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  29.25 
 
 		 420 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 		 1979 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 420 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  29.25 
 
 		 420 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  29.25 
 
 		 420 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  29.25 
 
 		 420 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 1737 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 420 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 420 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>