89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1514 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 105 aa  213  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2536  tetratricopeptide TPR_2  39.29 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.949555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  34 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  37.66 
 
 		 436 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0714  hypothetical protein  36.47 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  35.63 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  28.71 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 391 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1358  hypothetical protein  31.37 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 870 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 567 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 718 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  26.73 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 396 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 		 632 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  26.73 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 563 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.47 
 
 		 887 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  36.76 
 
 		 1067 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  34.21 
 
 		 417 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 329 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 587 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.77 
 
 		 916 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 878 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 620 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  31 
 
 		 791 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.17 
 
 		 540 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 4079 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 318 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 375 aa  43.5  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 		 594 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.38 
 
 		 764 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 810 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 750 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 3560 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 3145 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.8 
 
 		 758 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 927 aa  42  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 389 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.38 
 
 		 620 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  23.53 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.14 
 
 		 742 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.43 
 
 		 967 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  38.24 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  32.56 
 
 		 745 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  31.63 
 
 		 799 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 568 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 594 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 466 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.47 
 
 		 880 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 686 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 448 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 416 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  28.92 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.47 
 
 		 622 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 		 638 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.11 
 
 		 626 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.11 
 
 		 626 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  28.57 
 
 		 682 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 409 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.11 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.11 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.17 
 
 		 725 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 750 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  35.29 
 
 		 267 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 566 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30.1 
 
 		 619 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.11 
 
 		 715 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 699 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  30.53 
 
 		 1271 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 1213 aa  40  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 356 aa  40  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1450 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.66 
 
 		 571 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 1034 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 448 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>