35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1794 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 416 aa  854    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  50.14 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  48.05 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  39.79 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  35.7 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  35.45 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 406 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  29.82 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  25.88 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  23.71 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  22.3 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  21.68 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 968 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  22.84 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.71 
 
 		 1764 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.81 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.17 
 
 		 706 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 		 233 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 689 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>