56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0594 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  98.23 
 
 		 395 aa  809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 395 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  86.08 
 
 		 395 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  99.24 
 
 		 395 aa  815    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  74.01 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  74.01 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  74.01 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  73.74 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  55.56 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  53.21 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  55.2 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  53.44 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  52.6 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  53.66 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  31.87 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  30.38 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  30.85 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  26.99 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  24 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.84 
 
 		 810 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 878 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1112 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.23 
 
 		 725 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.1 
 
 		 733 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.44 
 
 		 587 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 957 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 		 579 aa  47  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 571 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 632 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 263 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.67 
 
 		 415 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 718 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  29.82 
 
 		 661 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 		 1288 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 149 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 3145 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 263 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 968 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 		 582 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.71 
 
 		 816 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>