168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0530 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 392 aa  809    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  45.38 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  38.3 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  33.85 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 397 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 397 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  33.51 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 406 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  28.53 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  28 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  27.33 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  23.41 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  22.3 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  30.41 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1676 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 1486 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 3172 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.11 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 3301 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  30.5 
 
 		 936 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 		 810 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 878 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 638 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0009  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.75 
 
 		 620 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 571 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.9 
 
 		 1694 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.4 
 
 		 837 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.18 
 
 		 632 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 567 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.1 
 
 		 1077 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 1252 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  25.3 
 
 		 174 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 1252 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 789 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 299 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 718 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 542 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.77 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 643 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 		 1056 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  24.09 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0703  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 197 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.247899  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0143  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.279427  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 689 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.47 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 589 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 266 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 265 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  27.33 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  20.96 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  25.68 
 
 		 815 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 808 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 247 aa  46.6  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1760  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 197 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 739 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 681 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.92 
 
 		 643 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.08 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.17 
 
 		 577 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  23.17 
 
 		 577 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.66 
 
 		 729 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1022 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.68 
 
 		 887 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.08 
 
 		 614 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.65 
 
 		 733 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.08 
 
 		 614 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 614 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>