More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0703 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0703  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.247899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1760  TPR repeat-containing protein  91.88 
 
 
197 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0143  TPR repeat-containing protein  90.86 
 
 
197 aa  361  3e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.279427  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0025  TPR repeat-containing protein  67.69 
 
 
197 aa  238  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
543 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
1276 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
602 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
562 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.11 
 
 
1979 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.75 
 
 
573 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.47 
 
 
1694 aa  78.2  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
927 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
1827 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
711 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
409 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
512 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.45 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.43 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
4489 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.96 
 
 
745 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.5 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 
784 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
3035 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 
836 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
402 aa  67  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 
366 aa  65.1  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
955 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.51 
 
 
730 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
279 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
1121 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.39 
 
 
635 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.88 
 
 
1138 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.11 
 
 
560 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.27 
 
 
417 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 
279 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
244 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
833 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.14 
 
 
1056 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.54 
 
 
1007 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
344 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 
296 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  19.4 
 
 
392 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
3560 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
523 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 
758 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.23 
 
 
743 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 
357 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.21 
 
 
810 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 
297 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
732 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
567 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  23.78 
 
 
582 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
361 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
425 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 
297 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 
289 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
761 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.06 
 
 
436 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.58 
 
 
707 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
750 aa  58.9  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
878 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
245 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 
1421 aa  58.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  21.96 
 
 
334 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  21.86 
 
 
295 aa  58.2  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 
465 aa  58.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  24.37 
 
 
269 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
4079 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
662 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.73 
 
 
397 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 
301 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.78 
 
 
988 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
306 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
1049 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.15 
 
 
439 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  21.86 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.18 
 
 
706 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 
314 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
1094 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  23.08 
 
 
398 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
289 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
393 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 
576 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.9 
 
 
542 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
452 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
254 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.11 
 
 
1022 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  28.42 
 
 
391 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.74 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
684 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 
1276 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>