More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1760 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1760  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0143  TPR repeat-containing protein  91.88 
 
 		 197 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.279427  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0703  TPR repeat-containing protein  91.88 
 
 		 197 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.247899  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0025  TPR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 543 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1276 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.25 
 
 		 573 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.11 
 
 		 1979 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 927 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.94 
 
 		 1694 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1827 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 711 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 409 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 4489 aa  71.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.9 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.88 
 
 		 745 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 		 784 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.95 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 836 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.67 
 
 		 560 aa  68.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 344 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1121 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 3035 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 		 635 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 414 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.63 
 
 		 1007 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.63 
 
 		 730 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 523 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.27 
 
 		 417 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 		 1056 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  23.78 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  21.11 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1421 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  20.4 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1138 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 436 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.31 
 
 		 576 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 3560 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 833 aa  62  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.37 
 
 		 743 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 279 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 		 357 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.08 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.18 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 955 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 750 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.73 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 4079 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 662 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 716 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 589 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1069 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 758 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.43 
 
 		 988 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  23.94 
 
 		 706 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  22.15 
 
 		 539 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 732 aa  58.2  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.77 
 
 		 542 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1049 aa  58.2  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.93 
 
 		 439 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1297 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.87 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  22.84 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 699 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  23.9 
 
 		 519 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  22.16 
 
 		 306 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.21 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  21.5 
 
 		 334 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 393 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 		 314 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.92 
 
 		 1056 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0235  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>