94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4120 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 380 aa  765    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  25.83 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  27.85 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  25.59 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  23.78 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  25.72 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  25.69 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  25.3 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  25.77 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 818 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 718 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  27.33 
 
 		 594 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  24.22 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 870 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 3145 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 909 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 		 784 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  28.1 
 
 		 246 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 583 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 612 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.7 
 
 		 816 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 864 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 637 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 634 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2688  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  24.85 
 
 		 780 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.9 
 
 		 258 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 739 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.67 
 
 		 725 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 685 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 697 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 681 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 988 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.12 
 
 		 733 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 927 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 		 323 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1069 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 169 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 1486 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  22.47 
 
 		 545 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  31.65 
 
 		 1098 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 203 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0226  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3172 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 3301 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 589 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 700 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.61 
 
 		 865 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.68 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 729 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0105  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  28.81 
 
 		 704 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1676 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25 
 
 		 887 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0703  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.247899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 205 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  38.89 
 
 		 977 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.18 
 
 		 632 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1039 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  26.85 
 
 		 550 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 762 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.52 
 
 		 837 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1088 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.9 
 
 		 603 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  27.89 
 
 		 615 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 641 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 557 aa  42.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.57 
 
 		 622 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>