More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0431 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 615 aa  1207    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 2262 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 2262 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 597 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.74 
 
 		 2240 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 3145 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 592 aa  64.7  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 878 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.31 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 718 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  28.31 
 
 		 246 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  27.11 
 
 		 780 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 870 aa  62  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3329  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 864 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 581 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  34.65 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.5 
 
 		 887 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.65 
 
 		 837 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  28.95 
 
 		 1077 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1676 aa  58.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  25.82 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.03 
 
 		 935 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.53 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 707 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 909 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 804 aa  57.4  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  27.27 
 
 		 255 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.12 
 
 		 733 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  33.66 
 
 		 266 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  33.66 
 
 		 267 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  33.66 
 
 		 266 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 685 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1198 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.48 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 646 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 		 836 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 248 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  20.91 
 
 		 1764 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  39.73 
 
 		 226 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.09 
 
 		 936 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.74 
 
 		 703 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.66 
 
 		 884 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 601 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 196 aa  54.3  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.63 
 
 		 370 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 691 aa  54.3  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 632 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 4079 aa  54.3  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 		 1034 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  36.56 
 
 		 259 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.16 
 
 		 632 aa  53.9  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  22.35 
 
 		 430 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.21 
 
 		 695 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.67 
 
 		 1979 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  26.14 
 
 		 1237 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  21.95 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  32.71 
 
 		 637 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 796 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1005 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.25 
 
 		 729 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  38.36 
 
 		 262 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 377 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.06 
 
 		 747 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  23.16 
 
 		 897 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 191 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.08 
 
 		 875 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.35 
 
 		 1677 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 503 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 3301 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 486 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  32.26 
 
 		 534 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  25.93 
 
 		 573 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 808 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.06 
 
 		 1154 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 402 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 673 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  36.99 
 
 		 256 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 247 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  27.59 
 
 		 587 aa  51.6  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>