More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0943 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  41.61 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 543 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 1276 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.08 
 
 		 818 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 366 aa  91.7  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.86 
 
 		 632 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 927 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 523 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 4489 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.96 
 
 		 784 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.72 
 
 		 462 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 878 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 363 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 562 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 4079 aa  85.5  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 		 740 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 		 1056 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1192 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.24 
 
 		 810 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 574 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.55 
 
 		 1022 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 602 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  32.47 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.18 
 
 		 1056 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.28 
 
 		 623 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 1094 aa  81.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 716 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 761 aa  81.3  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.97 
 
 		 1979 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 649 aa  81.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 		 685 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 		 988 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.48 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.57 
 
 		 1007 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.12 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 3560 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.99 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 1694 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 784 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1276 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 3035 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 711 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.68 
 
 		 745 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  40.17 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1827 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 935 aa  78.2  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 955 aa  78.2  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1069 aa  77.8  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 762 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  36.3 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  34.81 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 699 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1138 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.41 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.9 
 
 		 836 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30.41 
 
 		 706 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.94 
 
 		 573 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 512 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  30.89 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  33.78 
 
 		 816 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 452 aa  75.1  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  31.87 
 
 		 1013 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.57 
 
 		 795 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 361 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  34.09 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.03 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.52 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  30.12 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.37 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 637 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 		 635 aa  72.4  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 3145 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 670 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.54 
 
 		 560 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 450 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 243 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 291 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>