61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0895 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 354 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  30.47 
 
 		 481 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  28.49 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  25.53 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  23.33 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  29.36 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  25.45 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  26.56 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  28.11 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 878 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  26.71 
 
 		 615 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 792 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 1737 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 810 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  27.78 
 
 		 429 aa  52.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 602 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.43 
 
 		 573 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 833 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 1402 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.21 
 
 		 1979 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 632 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  23.26 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 808 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 700 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1297 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.79 
 
 		 703 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 833 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 802 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.13 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 601 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 3145 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  22.97 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.67 
 
 		 1252 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 573 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.26 
 
 		 561 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.49 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 4079 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 1252 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  22.73 
 
 		 403 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 		 2240 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 572 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>