46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0468 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 441 aa  879    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  93.88 
 
 		 441 aa  763    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  91.28 
 
 		 447 aa  791    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  60.84 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  52.22 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  46.7 
 
 		 451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  47.28 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  47.73 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  46.47 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  40.81 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  51.69 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  48.8 
 
 		 413 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  40.77 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  34 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  43.06 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  28.07 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  34.52 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  36.18 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  30.67 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  31.22 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  24.37 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  33.15 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  24.04 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  27.02 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 1737 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  32.11 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1085 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 700 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 2262 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  31.19 
 
 		 420 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  31.19 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  31.19 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 968 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 		 632 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 828 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>