68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0510 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 450 aa  908    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  90.11 
 
 		 451 aa  769    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  89.67 
 
 		 445 aa  758    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  94 
 
 		 446 aa  794    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  47.58 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  45.92 
 
 		 441 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  46.74 
 
 		 447 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  46.75 
 
 		 441 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  47.26 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 		 413 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  39.96 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  52.09 
 
 		 397 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  33.92 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  46.8 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  37 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  30.8 
 
 		 364 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  36.08 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  29.88 
 
 		 357 aa  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  25.78 
 
 		 373 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  24.23 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  25.53 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  32.02 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  29.83 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 3145 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 700 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.05 
 
 		 620 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.67 
 
 		 632 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 620 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.49 
 
 		 625 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 3301 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1461  tetratricopeptide TPR_2  21.99 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  29.61 
 
 		 604 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 968 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.01 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 750 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 718 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.14 
 
 		 875 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 		 1252 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.43 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 3172 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.75 
 
 		 576 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 1252 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 691 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.16 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 750 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  20.5 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1085 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 203 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 737 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 878 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.88 
 
 		 681 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 639 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.33 
 
 		 383 aa  43.5  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 828 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  22.93 
 
 		 2059 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 599 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>