61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0486 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  89.67 
 
 		 450 aa  744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  97.78 
 
 		 451 aa  820    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 445 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  89.01 
 
 		 446 aa  744    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  47.88 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  46.09 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  46.56 
 
 		 447 aa  356  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  49.78 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  46.57 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  40.13 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  33.63 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  46.31 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  37.5 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  27.31 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  27.44 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  36.6 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  28.81 
 
 		 357 aa  106  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  23.94 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  32.05 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  23.58 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  29.28 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 615 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.17 
 
 		 620 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  30.54 
 
 		 604 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 700 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.01 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  30 
 
 		 625 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 620 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 448 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 1154 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 968 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.51 
 
 		 632 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1461  tetratricopeptide TPR_2  21.99 
 
 		 194 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 3172 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 718 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.14 
 
 		 875 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  21.12 
 
 		 614 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 		 1252 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 599 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 		 1252 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 		 3301 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1085 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.48 
 
 		 576 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 596 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  29.59 
 
 		 673 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 737 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 691 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 339 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>