More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1461 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1461  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 		 635 aa  67.8  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.41 
 
 		 746 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.81 
 
 		 1979 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  26.53 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 927 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 433 aa  61.6  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 		 504 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 		 1240 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 988 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 565 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 818 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 878 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 4079 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1421 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.75 
 
 		 725 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 		 1056 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.26 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.26 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.34 
 
 		 1022 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1138 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1276 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1049 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.55 
 
 		 528 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.23 
 
 		 738 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 596 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 615 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  23.6 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 717 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 649 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 717 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 		 784 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.55 
 
 		 594 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  25 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 		 1056 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.86 
 
 		 820 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  26.35 
 
 		 527 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 955 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 465 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 543 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.2 
 
 		 462 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  27.21 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 406 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 406 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  27.54 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 458 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.32 
 
 		 810 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 593 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  26.11 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 605 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 391 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.56 
 
 		 577 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  26.22 
 
 		 905 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81748  mitochondrial outer membrane specialized import receptor  28.57 
 
 		 585 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 		 370 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1297 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 292 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 		 135 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 357 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1112 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 366 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  27.68 
 
 		 538 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.28 
 
 		 581 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 260 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 750 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 1192 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 295 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 286 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 634 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 286 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 301 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 605 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 422 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>