46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3661 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  90.83 
 
 		 441 aa  774    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  89.26 
 
 		 441 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 447 aa  892    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  60.26 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  52.77 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  46.93 
 
 		 451 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  46.79 
 
 		 445 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  46.32 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  46.14 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  40.93 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 		 413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  49.3 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  33.62 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  42.79 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  35.03 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  28.69 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  36.68 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  30.67 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  31.71 
 
 		 364 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  25.34 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  23.04 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  33.15 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  29.1 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 354 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 1737 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 2262 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  30.88 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1085 aa  47  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 3145 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  30.15 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  30.15 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  30.15 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  30.15 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 764 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 968 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0327  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 413 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>