54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4110 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  100 
 
 		 429 aa  859    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  60.49 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  60.53 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  53.99 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 451 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  49.12 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  47.75 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  46.72 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  41.36 
 
 		 428 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  40.23 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  52.74 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  33.71 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  32.27 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  26.82 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  34.36 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  25.97 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  31.61 
 
 		 357 aa  87  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  27.08 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  26.23 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  24.83 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  29.23 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1737 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 369 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 1085 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 3145 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 737 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 700 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  24.63 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  30.88 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 3301 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 810 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 968 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 643 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  27.7 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 750 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  27.7 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  27.7 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  27.78 
 
 		 690 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  27.7 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>