More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03573 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  55.07 
 
 		 689 aa  706    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  62.46 
 
 		 690 aa  824    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  62.03 
 
 		 690 aa  806    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  100 
 
 		 690 aa  1343    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.45 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 878 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.73 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.9 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.57 
 
 		 937 aa  63.9  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1676 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.15 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 767 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 286 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 351 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.44 
 
 		 3145 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.54 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.94 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  28.21 
 
 		 636 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.04 
 
 		 929 aa  58.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25 
 
 		 832 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 4079 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 827 aa  57.4  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.88 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 886 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 		 988 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.87 
 
 		 1979 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 883 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.68 
 
 		 725 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.13 
 
 		 681 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 405 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.22 
 
 		 2240 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 762 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 542 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  29.47 
 
 		 781 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 357 aa  55.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 732 aa  55.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 639 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 329 aa  55.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 935 aa  54.7  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 776 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 1406 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.59 
 
 		 784 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 399 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.18 
 
 		 733 aa  54.3  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  21.47 
 
 		 820 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 608 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.65 
 
 		 864 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  29.23 
 
 		 1237 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.15 
 
 		 577 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.6 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 581 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 363 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 754 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 363 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 279 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 789 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.48 
 
 		 610 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.48 
 
 		 884 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  33.53 
 
 		 784 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 		 593 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 1252 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 201 aa  52.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 502 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 754 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1138 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 860 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.61 
 
 		 573 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 572 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.71 
 
 		 330 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 207 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  28.22 
 
 		 502 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.69 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 		 1486 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>