46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4415 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 397 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  45.91 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  35.55 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  52.09 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  52.56 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  52.56 
 
 		 445 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  52.09 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  51.46 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  51.46 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3749  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.541109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  33.09 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  32.87 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  34.33 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  25.56 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  32.51 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  31.3 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  25 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  28.57 
 
 		 357 aa  86.7  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  23.75 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  26.95 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  26.67 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 3145 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.24 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.6 
 
 		 730 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.08 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 927 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 602 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 688 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1297 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1085 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 466 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 3172 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.47 
 
 		 725 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 828 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  30.71 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 3301 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>