73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0766 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 369 aa  701    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0895  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.643748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0387  putative MshA biogenesis protein, MshN-like  32.2 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0172  hypothetical protein  23.33 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3272  hypothetical protein  39.88 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  26.49 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0562  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0510  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3661  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0468  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4415  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2822  MSHA biogenesis protein MshN  28.18 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00253  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshN (pilus type IV)  21.98 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002370  MSHA biogenesis protein MshN  23.76 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0471  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHN)  23.59 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0546  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  32.45 
 
 		 673 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4110  MSHA biogenesis protein MshN, putative  27.92 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3484  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.317992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.88 
 
 		 725 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 632 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.71 
 
 		 622 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 808 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 2240 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 744 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3345  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.138271  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 3560 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4574  putative MSHA biogenesis protein MshN  26.34 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03696  hypothetical protein  23.82 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.31 
 
 		 816 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.14 
 
 		 739 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 927 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 833 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.51 
 
 		 587 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 598 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  33.64 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 828 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.16 
 
 		 764 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 2262 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 657 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.16 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.75 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 934 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 667 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86206  self-glucosylating initiator of glycogen synthesis  27.91 
 
 		 625 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.355128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 619 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  29.33 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 833 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 732 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 689 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 599 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 615 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 274 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.27 
 
 		 545 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>