71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1662 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 342 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 233 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  35.86 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  32.57 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  32.6 
 
 		 253 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  35.33 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  34.08 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  30.04 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  34.29 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  33.53 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  27.96 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  29.95 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  31.9 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  35.22 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  30.54 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 632 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 808 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  29.75 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.62 
 
 		 810 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 878 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  36.17 
 
 		 790 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 3145 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 879 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 374 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0766  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146573  normal  0.0797434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 767 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 615 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  29.35 
 
 		 924 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  44.64 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 766 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 790 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  32.58 
 
 		 708 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 1085 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 620 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 637 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.35 
 
 		 725 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 639 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 718 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 1005 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1421 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12218  hypothetical protein  27.52 
 
 		 437 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 1252 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>