58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1727 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  87.14 
 
 
280 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  65.76 
 
 
295 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  60.5 
 
 
275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  60.5 
 
 
275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  60.5 
 
 
275 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  59.43 
 
 
275 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  72.64 
 
 
295 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  72.33 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  72.33 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  72.33 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  72.33 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  72.33 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  63.04 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  64.17 
 
 
284 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  48.2 
 
 
305 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.06 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.06 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  42.08 
 
 
311 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  40.29 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 
287 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.95 
 
 
306 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  42.94 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  35.81 
 
 
279 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.81 
 
 
279 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
237 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  31.92 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  36.42 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  33.12 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  29.26 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
409 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  28.96 
 
 
229 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
2262 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  31.09 
 
 
398 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0993  putative lipoprotein  31.76 
 
 
477 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0358933  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  31.9 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
409 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
1402 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 
471 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
781 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 
821 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 
776 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 
776 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.62 
 
 
622 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 
776 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
1737 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 
650 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
1056 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
326 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
780 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  26.47 
 
 
780 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 
641 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>