100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0843 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  57.02 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  55.11 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  59.2 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  42.36 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  43.68 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  33.49 
 
 		 342 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  33.96 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  32.53 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.76 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  30.05 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  32.16 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.05 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  31.86 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  29.9 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  34.46 
 
 		 295 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 343 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  30.82 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  28.82 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  36.36 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1038 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 448 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  30.34 
 
 		 514 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.07 
 
 		 352 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 636 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 415 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 		 612 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5699  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.96 
 
 		 601 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.426471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0272  hypothetical protein  38.46 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 635 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 635 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 611 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47492  predicted protein  30.11 
 
 		 640 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00475484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.84 
 
 		 801 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 667 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1714 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1005 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.85 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 594 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 718 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 821 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 1450 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 776 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  38.55 
 
 		 480 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  30.65 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 1089 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.66 
 
 		 620 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  30.68 
 
 		 542 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 2240 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 821 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 461 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 3145 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 824 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 776 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 776 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 776 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 776 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 620 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 362 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 395 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 637 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.72 
 
 		 884 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 3035 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 637 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 639 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 288 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 520 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 203 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 1034 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 974 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 315 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  25.62 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>