65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4666 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  100 
 
 
275 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  90.91 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  90.91 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  90.91 
 
 
275 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  61.69 
 
 
295 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  62.31 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  74.53 
 
 
295 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  64.15 
 
 
280 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  71.62 
 
 
311 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  62.55 
 
 
284 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  62.6 
 
 
284 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  42.61 
 
 
311 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  39.56 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.52 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.52 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  41.31 
 
 
305 aa  161  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.15 
 
 
306 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  44.17 
 
 
343 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 
287 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.18 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  33.18 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
237 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  33.53 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  33.12 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  33.33 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  28.4 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  30.68 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  30.39 
 
 
231 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  31.07 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
409 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
409 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
1737 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
607 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.85 
 
 
512 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
613 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
776 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  29.91 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
821 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
776 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
776 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 
2240 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
821 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1194  Tetratricopeptide domain protein  37.29 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.76 
 
 
613 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
776 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 
607 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
607 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
607 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
776 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
566 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.06 
 
 
733 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 
716 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
607 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.29 
 
 
818 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>