62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2067 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  42.38 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.39 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  43.07 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  41.04 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  40.65 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  43.88 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  43.72 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  43.22 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  38.65 
 
 		 273 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.71 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 287 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  38.99 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.32 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  30.32 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  32.94 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  30.62 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  27.45 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  28.82 
 
 		 231 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  26.39 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  27.85 
 
 		 245 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 139 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  31.34 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 716 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.89 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 828 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  27.88 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  27.68 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 632 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 566 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1038 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.63 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  28.8 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.63 
 
 		 784 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  37.29 
 
 		 518 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.09 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 3145 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0602  RNA polymerase alpha subunit domain protein  28.57 
 
 		 451 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>