98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5414 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 287 aa  567  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  66.12 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.72 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.72 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  43.7 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.22 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  41.95 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  43.72 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  39.75 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  39.75 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  49.72 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.93 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  40.55 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  37.66 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  35.66 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 		 343 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  34.62 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  35.26 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  35.54 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  31.16 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  32.57 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.65 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.13 
 
 		 784 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 		 1056 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.27 
 
 		 340 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 		 810 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 875 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 562 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 713 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  28.41 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 878 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.93 
 
 		 733 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 818 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 1737 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 352 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 632 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 824 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 468 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 358 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 		 480 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 486 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 566 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 685 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 744 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.57 
 
 		 622 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 767 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 		 988 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 464 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  28 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.84 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.29 
 
 		 707 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 1056 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 629 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  29.32 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.63 
 
 		 887 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 1061 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 927 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 3145 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.57 
 
 		 577 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.34 
 
 		 581 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  32.04 
 
 		 488 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  27.89 
 
 		 437 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 1005 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.52 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 585 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.74 
 
 		 646 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.57 
 
 		 577 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 573 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 761 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0928  heat shock protein DnaJ-like  33.33 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  28.21 
 
 		 425 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 583 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 343 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25.45 
 
 		 415 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>