42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0643 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  65.12 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  64.44 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  57.02 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  44.14 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  42.98 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  35.86 
 
 		 342 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  34.07 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  30.68 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  28.88 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  29.5 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.5 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  31.36 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  31.31 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  29.05 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  31.07 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  31.07 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  29.94 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 399 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  32.8 
 
 		 781 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 405 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 217 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 3145 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  35.82 
 
 		 1237 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>