83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4450 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.57 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  45.33 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  40.53 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  40.53 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  43.1 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  50.86 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  42.61 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  45.86 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  44.34 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.2 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.2 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  41.41 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  35.27 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.66 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  34.78 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  31.66 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  30.04 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  29 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  28.88 
 
 		 229 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  30.96 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 613 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  34.43 
 
 		 613 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  29.27 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1038 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.13 
 
 		 587 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 592 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 927 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.14 
 
 		 622 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 613 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 776 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 776 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 821 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 716 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 821 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 		 955 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 776 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  32.93 
 
 		 577 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  26.74 
 
 		 616 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  32.93 
 
 		 577 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 707 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  28.39 
 
 		 797 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 1486 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  33.72 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 1737 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.22 
 
 		 589 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  35.71 
 
 		 1764 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.18 
 
 		 863 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.49 
 
 		 764 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 934 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  35.42 
 
 		 587 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  27.37 
 
 		 495 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  25.23 
 
 		 780 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.63 
 
 		 637 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.92 
 
 		 545 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>